在協作機制上，滁州市、馬鞍山市分別與江蘇省南京市聯合成立一體化展開示范區建造工作領導小組，統籌和諧示范區建造;縣區層面相應成立由雙方政府主要負責同志擔任雙組長的建造工作推動小組;市場化運作方面，來安縣與南京市江北新區、滁州市南譙區與南京市浦口區分別合資成立投資公司，負責片區投融資與開發建造。

工業，是省際毗連區域新式功用區展開的根基。一批批重大項目紛紛落地，撐起了工業“脊柱”。

寧滁新式功用區環繞電子信息、生物醫藥兩大主導工業上下游龍頭企業展開招商;寧馬新式功用區堅持全員招商、工業鏈招商、基金招商等形式，環繞“一高三新”工業定位展開招商。兩個新式功用區掛牌以來，累計引進億元以上項目34個、總投資837.1億元。

以馬鞍山市博望區為例，該區是“中國機床刃模具之鄉”。近年來，博望區經過基地建造、園區晉級、“優二進三”、精準招商四大工程，推動“東向戰略”施行。

2021年7月，寧馬省際毗連區域新式功用區掛牌后，博望區迎來一體化展開的新機遇，新式功用區把“雙招雙引”作為經濟展開的頭等大事，著力打造1個先進智能制作工業基地，建造長三角省際毗連區域社會治理體制創新和省際同城化展開2個示范區，推動規劃編制、基礎設施等“六個一體化”，實現了展開途徑新打破。

環繞民生同享，寧滁、寧馬新式功用區展開教育、醫療、公共服務等多項協作，讓廣大大眾享受到一體化紅利。在醫療協作方面，2018年，馬鞍山市博望區新城中醫院與江蘇省中醫院簽定協作協議，江蘇省中醫院急診科供給技術指導、雙向轉診、人員培訓等協助;來安縣二院與南醫大二附院簽署協作協議，由南醫大二附院對縣二院輸出專業人才和管理經驗，派出專家到醫院定期坐診;南京市浦口區、滁州市南譙區一起推動江蘇省人民醫院浦口分院與滁州市第五人民醫院協作共建特征疼痛專科。